本發(fā)明提供了轉(zhuǎn)基因水稻B1C893的旁側(cè)序列核酸，其包括右旁側(cè)序列核酸和/或左旁側(cè)序列核酸；所述右旁側(cè)序列核酸的序列為SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.1的片段；所述左旁側(cè)序列核酸的序列為SEQ ID NO.9或SEQ ID NO.9的片段。本發(fā)明還提供了與轉(zhuǎn)基因水稻B1C893的旁側(cè)序列核酸互補的核酸。本發(fā)明還提供了檢測轉(zhuǎn)基因水稻B1C893及其產(chǎn)品的方法、引物、探針、試劑盒、基因芯片和它們的用途。通過上述技術(shù)方案，本發(fā)明成功地實現(xiàn)了轉(zhuǎn)基因水稻B1C893或者由B1C893通過各種育種方法產(chǎn)生的含有該核酸片段的水稻衍生系及其產(chǎn)品的檢測。